巨蟹座的馬英九極度保護家人，非常不希望政治入侵他的家庭，也不希望家人涉入他的政治工作，這項堅持不僅媒體記者感受深刻，馬英九家人甚少在公開場合發表意見，就是明證。

親近馬英九人士觀察，馬英九30幾歲就在蔣經國身邊歷練，見識過宮廷的險惡，也因此深諳潔身自愛的重要性；而歷史經驗告訴他，把家人扯入政治，不僅永無寧日，且常無好下場，對照時下許多政治人物，馬英九的堅持算是正確、可取的。

妻子周美青除了選舉時幫他拉票，其他時間都謹守分際，閉口不談馬英九工作上的是非；從她的角度來看，周美青很珍惜自己在財經專業的成就，嚴守分際不僅不干擾馬英九，也不讓自己的專業形象減分，許多朋友都對她的表現相當讚賞。

馬英九和他的一對女兒感情很好。馬英九擔任法務部長期間，雷厲風行查察賄選行動雖然大快人心，也得罪權勢之人，儘管民調施政滿意度高達八成八，依舊被調離法務部，轉任行政院政務委員，他感慨萬千。這時，大女兒馬唯中安慰他：「爸，想開點，其實你已經很幸運了，在古代可能會被殺頭的。」

馬唯中從北一女畢業，馬英九夫婦建議她出國深造，馬唯中選擇赴哈佛大學就讀，這件事給馬英九很大的安慰，事後他慚愧地說，他在女兒身上下的功夫，遠不如他父親在自己身上下的功夫，即使小女兒馬元中赴美讀書，馬英九也因忙於市政而無暇送行，私下感到內疚。

先前馬英九赴美訪問，在哈佛做了一場成功的演講，演講結束後，他急著要看看久未謀面的女兒馬唯中，幕僚稱讚他演講很棒，他沒心情地笑著說：「演講不重要，女兒最重要！」流露出愛女心切的神態，而馬唯中見了父親，只見她臉上堆著優雅靦腆的笑容，不太跟馬英九撒嬌，旁人看了直覺得父女兩人真像，雖然彼此想念，卻不易顯露個人的情感。