向來以清廉自持的總統馬英九，從政一路堅持清廉，他也說過清廉是政治人物的生命，因此連妻子周美青都相當低調、毫不奢華，但馬總統的清廉，未必適用所有人，因為被歸在馬家軍的政院秘書長林益世因涉貪，已主動請辭並獲准，這似乎也符合馬總統的清廉底線。

隨著林益世風暴擴大，各界都在關注馬政府上下動態，馬總統29日依照既定行程，上午依舊南下出席陸軍官校的三軍五校畢業典禮，雖然媒體形容總統進入會場時不發一語、臉色凝重。

但實際上，馬英九並未因此受影響，而是依舊按行程走；而一度傳出林益世涉貪已踩到馬的底線，因而要求林益世主動請辭，但林自認清白而不願請辭。事隔一夜，林益世火速請辭，似乎也符合了馬總統的期待。